Bulletin n°531
Sommaire
Dépistage, diagnostic, pronostic
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Découverte de technologies et de biomarqueurs (3)
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Menée aux Etats-Unis à partir de l'analyse informatique de données clinicogénomiques portant sur 40 903 patients atteints d'un cancer, cette étude identifie 458 mutations permettant, pour huit types de cancer, de prédire la survie des patients recevant une immunothérapie spécifique, une chimiothérapie ou une thérapie ciblée, puis caractérise les interactions entre les mutations génétiques qui affectent les résultats des thérapies ciblées
Systematic pan-cancer analysis of mutation–treatment interactions using large real-world clinicogenomics data
Nature Medicine, résumé, 2022
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Menée à partir d'échantillons de carcinomes à cellules claires et à l'aide d'une nouvelle technique d'hybridation in situ en fluorescence nommée "hybridisation chain reaction", cette étude analyse la localisation de 16 longs ARNs non codants (lncRNAs) et met en évidence une association entre les niveaux d'expression d'un panel de trois lncRNAs (TUG1, HOTAIR et CDKN2B-AS1) et le pronostic
Hybridisation chain reaction-based visualisation and screening for lncRNA profiles in clear-cell renal-cell carcinoma
British Journal of Cancer, résumé, 2022
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Menée à l'aide de données portant sur 444 patientes atteintes d'un cancer séreux ovarien primitif de haut grade et de stade avancé, cette étude met en évidence l'intérêt de fusionner des données histopathologiques, radiologiques et clinico-génomiques à l'aide d'algorithmes d'apprentissage automatique pour établir avec plus de précision un pronostic et améliorer la stratification des patientes
Multimodal data integration using machine learning improves risk stratification of high-grade serous ovarian cancer
Nature Cancer, article en libre accès, 2022
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Essais de technologies et de biomarqueurs dans un contexte clinique (2)
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Menée à partir de données de séquençage de l'ARN portant sur 1 684 tumeurs de l'endomètre, du sein ou de l'ovaire puis sur 4 038 échantillons tumoraux supplémentaires, cette étude identifie une signature transcriptionnelle permettant d'identifier des tumeurs présentant une déficience du système de réparation de l'ADN par recombinaison homologue
Discovery and validation of a transcriptional signature identifying homologous recombination-deficient breast, endometrial and ovarian cancers
British Journal of Cancer, résumé, 2022
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Menée en Angleterre à partir de données portant sur 28 137 patients atteints d'un adénocarcinome canalaire du pancréas et 261 219 témoins, cette étude analyse l'association entre l'évolution de différents marqueurs (indice de masse corporelle, marqueurs hépatiques, numération sanguine, ...), la présence de comorbidités, l'utilisation de médicaments et le risque de diagnostiquer un adénocarcinome canalaire du pancréas
Temporality of body mass index, blood tests, comorbidities and medication use as early markers for pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC): a nested case–control study
Gut, article en libre accès, 2021
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Ressources et infrastructures (2)
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Menée à partir de l'analyse transcriptomique de cellules épithéliales issues de patients atteints d'un cancer colorectal, cette étude identifie deux sous-types tumoraux permettant d'affiner la classification CMS
Single-cell and bulk transcriptome sequencing identifies two epithelial tumor cell states and refines the consensus molecular classification of colorectal cancer
Nature Genetics, article en libre accès, 2022
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Cette étude analyse la pertinence de deux modèles prédictifs du risque de cancer controlatéral du sein ainsi que d'informations sur le risque de récidive distante ou régionale et sur la mortalité non liée au cancer du sein pour décider de réaliser ou non une mastectomie prophylactique du sein controlatéral
Tools for Contralateral Prophylactic Mastectomy Decision Making
Journal of Clinical Oncology, résumé, 2021
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Évaluation des technologies et des biomarqueurs (2)
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Menée à partir de l'analyse par microscopie numérique de 39 échantillons de carcinomes thymiques ayant fait l'objet d'une coloration immunohistochimique, cette étude évalue l'association entre les caractéristiques du microenvironnement immunitaire de la tumeur et la survie ainsi que le risque d'envahissement tumoral ou de récidive
Tumour immune microenvironment in resected thymic carcinomas as a predictor of clinical outcome
British Journal of Cancer, résumé, 2022
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Menée à partir de données portant sur 783 patients atteints d'un myélome multiple, cette étude évalue la performance d'un système de score, basé sur les antécédents de thromboembolie veineuse, les antécédents chirurgicaux, l'utilisation d'immunomodulateurs, la présence d'anomalies au niveau des résultats de l'analyse cytogénétique en métaphase et l'origine ethnique, pour identifier les patients présentant un risque élevé de thromboembolie veineuse
Abnormal Metaphase Cytogenetics Predicts Venous Thromboembolism in Myeloma: Derivation and Validation of the PRISM Score
Blood, résumé, 2021
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