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Multiomic integration reveals tumoral heterogeneity of lipid dependence within lethal group 3 medulloblastoma

Menée à l'aide de lignées cellulaires, de xénogreffes sur des modèles murins et de l'analyse multiomique de 384 échantillons tumoraux prélevés sur des patients atteints d'un médulloblastome, cette étude démontre que le métabolisme des lipides diffère selon le sous-type protéomique de la tumeur, met en évidence un mécanisme par lequel l'inhibition de la voie de signalisation MYC-FASN-SCD provoque l'absorption d'acides gras exogènes pour compenser l'arrêt de la biosynthèse des lipides et révèle le rôle de MYC dans le stockage des lipides et la survie de la tumeur

Medulloblastoma, the most common malignant brain tumor of childhood, exhibits significant biological complexity that demands deeper exploration. Here, we present a large multiomics dataset integrating data from 384 primary medulloblastoma patient samples across five omic layers: CpG methylome, transcriptome, proteome, phosphoproteome, and metabolome, paired with associated clinical metadata. Data integration revealed intertumoral heterogeneity of lipid metabolism across proteomic subtypes. Notably, while the MYC-FASN-SCD axis drives lipid biosynthesis, pathway inhibition elicits a compensatory escape mechanism in vivo through exogenous fatty acid uptake. Unexpectedly, we demonstrated that MYC triggers lipid storage, creating a unique dependency on lipid droplet-mitochondria communications to sustain tumor maintenance in vivo. Together, this comprehensive analysis reveals a targetable vulnerability downstream of MYC that constitutes a promising therapeutic approach to treat currently untreatable medulloblastoma subtypes.

Cancer Cell , résumé, 2026

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